1900年 (明治33年) 正田貞一郎などにより、群馬県館林町に日清製粉の前身「館林製粉株式会社」が設立された。 1908年 (明治41年) 横浜に工場建設中の「日清製粉株式会社」を合併し、社名を「日清製粉株式会社」と改めた。本社を「東京市日本橋区小網町2丁目11番地」に移転。 1926年 (大正15年) 鶴見工場建設。日清製粉の代表工場として、小麦粉輸出の道をひらいた。 1945年 (昭和20年) 第二次大戦により工場の大半を焼失したが、罹災後ただちに復興に着手した。 1949年 (昭和24年) 全工場の復旧、増設をほぼ完了、戦後の食糧増産の要請にこたえた。 1957年 (昭和32年) 鶴見工場に西独・ミアグ社製、神戸工場にスイス・ビューラー社製の最新式ニューマチック方式製粉設備を装置し、日本における製粉設備近代化に先鞭をつけた。 1960年 (昭和35年) 関連会社「中外興業株式会社」の社名を「日清飼料株式会社」に改めた。 1961年 (昭和36年) 日清飼料から配合飼料の製造、研究部門を譲り受け、経営の多角化時代が始まった。 1962年 (昭和37年) 「日清フーズ株式会社」を設立。ケーキミックス類の製造販売を開始。 1965年 (昭和40年) 日清フーズより製造・研究部門を譲り受けた。また直系会社「日清長野化学工業株式会社」の名称を「日清化学株式会社」に改める。 1966年 (昭和41年) 業務用ドーナツミックス類およびドーナツ製造機械の製造、販売を目的として米国のDCA Food Industries Inc.と提携し、合弁会社「日清ディー・シー・エー食品株式会社」を設立。 1967年 (昭和42年) 日清フーズが関連会社「マ・マーマカロニ株式会社」から販売部門を譲り受けた。 1970年 (昭和45年) 畜産事業を行うため「株式会社日清畜産センター」を設立。また、ペットフードの販売を行うため「日清ペット・フード株式会社」を設立した。 1972年 (昭和47年) エンジニアリング業務を行うため「日清エンジニアリング株式会社」を設立。関連会社「大山ハム株式会社」の名称を「日清ハム株式会社」に改めた。 1978年 (昭和53年) 冷凍めん関連の事業を行うため「フレッシュ・フード・サービス株式会社」を設立。 1987年 (昭和62年) 「日清フーズ株式会社」及び「日清化学株式会社」を合併した。 1988年 (昭和63年) タイ国に合弁会社「タイ日清製粉株式会社」を設立。 1989年 (平成元年) 「株式会社日清経営技術センター」を設立。「ザ・ ゴルフガーデン高島平」が営業を開始。カナダの製粉会社「ロジャーズ・フーズ株式会社」を買収。 1991年 (平成3年) タイ国に合弁会社「タイ日清DCA株式会社」及び「日清STC製粉株式会社」を設立。情報システム部が、「日清情報システム株式会社」として独立。 1994年 (平成6年) DCA Food Industries Inc.が所有する「日清ディー・シー・エー食品」の全株式を取得。 1995年 (平成7年) 阪神大震災により神戸工場、東灘工場が被害を受けたが同年内に復旧を完了。 1996年 (平成8年) 日清製粉と杏林製薬(株)が折半出資の「日清キョーリン製薬株式会社」(日清製薬に杏林製薬が資本参加)を設立。米国でパスタの製造・販売を行うため、ワシントン州に「メダリオン・フーズ・インク」を設立。 1997年 (平成9年) 日清ディー・シー・エー食品(株)及びタイ日清DCA(株)の社名を「日清テクノミック株式会社」及び「タイ日清テクノミック株式会社」に改めた。冷凍食品事業を分社化し「日清フーズ株式会社」を設立。 1998年 (平成10年) 千代田区神田錦町に本社ビルを取得し、3月に移転。 1999年 (平成11年) 日清テクノミック株式会社を合併。小網町ビル（旧本社）の耐震改修工事が完了。東部本部、食品開発研究所、関連会社が移転した。 2000年 (平成12年) 10月27日　創業100周年を迎える。 2001年 (平成13年) 7月2日　製粉、食品、飼料、医薬、ペットフードの全事業を分社。新しい日清製粉グループがスタート。 2002年 (平成14年4月) 中国において「青島日清製粉食品有限公司」を設立。 2002年 (平成14年10月) 「日清製粉株式会社」鶴見工場Ｇミル増設。 2003年 (平成15年4月) 「オリエンタル酵母工業株式会社」の株式を追加取得し連結子会社化。 2003年 (平成15年10月) 「日清飼料株式会社」と「丸紅飼料株式会社」との経営統合による「日清丸紅飼料株式会社」（持分法適用関連会社）の運営開始。 2004年 (平成16年3月) 「イニシオフーズ株式会社」を設立 2004年 (平成16年12月) 「ロジャーズ・フーズ株式会社」はカナダのチリワック市に新製粉工場を竣工。 2005年 (平成17年7月) 中国において「新日清制粉食品（青島）有限公司」を設立。 2005年 (平成17年10月) 「イニシオフーズ株式会社」が「株式会社三幸」を吸収合併。 2005年 (平成17年11月) 中国において株式会社ニチレイとの合弁会社「錦築（煙台）食品研究開発有限公司」を設立。平成18年10月から運営開始。